Chung Sân nhà Sân khách
| TT | ĐỘI | TrST | ThT | HH | BB | HS | ĐĐ |
|---|
| 1 |  Panathinaikos | 2 | 2 | 0 | 0 | +5 | 6 |
| 2 |  Lugano | 2 | 2 | 0 | 0 | +4 | 6 |
| 3 |  Brann | 2 | 2 | 0 | 0 | +4 | 6 |
| 4 |  Trabzonspor | 2 | 2 | 0 | 0 | +4 | 6 |
| 5 |  FC Twente | 2 | 2 | 0 | 0 | +4 | 6 |
| 6 |  AS Monaco | 2 | 2 | 0 | 0 | +4 | 6 |
| 7 |  St.Truiden | 2 | 2 | 0 | 0 | +3 | 6 |
| 8 |  Hajduk Split | 2 | 2 | 0 | 0 | +2 | 6 |
| 9 |  Brighton | 2 | 1 | 1 | 0 | +4 | 4 |
| 10 |  FC Copenhagen | 2 | 1 | 1 | 0 | +3 | 4 |
| 11 |  CS Universitatea Craiova | 2 | 1 | 1 | 0 | +2 | 4 |
| 12 |  Mjaellby | 2 | 1 | 1 | 0 | +2 | 4 |
| 13 |  Ajax | 2 | 1 | 0 | 1 | +1 | 3 |
| 14 |  Borac Banja Luka | 2 | 1 | 0 | 1 | +1 | 3 |
| 15 |  Atalanta | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 3 |
| 16 |  SC Braga | 2 | 1 | 0 | 1 | -1 | 3 |
| 17 |  Gent | 2 | 1 | 0 | 1 | -1 | 3 |
| 18 |  Freiburg | 2 | 1 | 0 | 1 | -2 | 3 |
| 19 |  FC Nordsjaelland | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 |
| 20 |  KF Egnatia | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 |
| 21 |  Riga FC | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 2 |
| 22 |  Crvena Zvezda | 2 | 0 | 1 | 1 | -1 | 1 |
| 23 |  PFC CSKA Sofia | 2 | 0 | 1 | 1 | -1 | 1 |
| 24 |  Jablonec | 2 | 0 | 1 | 1 | -1 | 1 |
| 25 |  FC Midtjylland | 2 | 0 | 1 | 1 | -1 | 1 |
| 26 |  AGF | 2 | 0 | 1 | 1 | -1 | 1 |
| 27 |  Pafos FC | 2 | 0 | 1 | 1 | -2 | 1 |
| 28 |  Hearts | 2 | 0 | 1 | 1 | -2 | 1 |
| 29 |  FC Iberia 1999 | 2 | 0 | 1 | 1 | -2 | 1 |
| 30 |  Getafe | 2 | 0 | 1 | 1 | -3 | 1 |
| 31 |  Kairat Almaty | 2 | 0 | 1 | 1 | -4 | 1 |
| 32 |  Thun | 2 | 0 | 0 | 2 | -2 | 0 |
| 33 |  Lincoln Red Imps FC | 2 | 0 | 0 | 2 | -4 | 0 |
| 34 |  KuPS | 2 | 0 | 0 | 2 | -4 | 0 |
| 35 |  Inter Club d'Escaldes | 2 | 0 | 0 | 2 | -4 | 0 |
| 36 |  FK Kauno Zalgiris | 2 | 0 | 0 | 2 | -7 | 0 |
- Vào thẳng vòng 1/8
- Play off vòng 1/8
- Bị loại
Nếu các đội kết thúc với số điểm bằng nhau vào cuối mùa giải, hiệu số điểm sẽ là yếu tố quyết định